ここでは、日本におけるオルタナティブ教育を見ていきます。オルタナティブ教育の対象は、幼児教育、初等教育、中学校教育、高校教育など、どの年齢のレベルにおいてもオルタナティブ教育は存在します。その中でも、日本でのオルタナティブ教育の考え方は大きく二つに分けることが出来るようです。
一つ目のオルタナティブ教育は幼児教育です。モンテッソーリ教育やシュタイナー教育を行っているところを指します。二つ目には、不登校児のための学校であるフリースクールや、サポート校を指します。
不登校児のための学校で行う教育を受けるだけでは、社会的に、正規の卒業をしたこととして認められません。卒業をした認定が欲しい場合には、従来の教育方法を行う学校に通い卒業しなければなりません。また、文部省が行う認定試験に合格すれば、正規の卒業資格を得ることが出来ます。このような卒業資格を得れば、社会的に認められた資格となりますので、履歴書に記載することも出来ますし、上の学校へ進むための資格を得たことにもなるのです。
また、自由な教育がオルタナティブ教育の方法だからと言って、日本の進学塾や受験専門に行っている塾はオルタナティブ教育の方法には含まれません。